284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0394 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  703    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  77.47 
 
 
352 aa  551  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  78.06 
 
 
352 aa  548  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  69.97 
 
 
330 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  69.97 
 
 
330 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  69.63 
 
 
334 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  69.66 
 
 
333 aa  484  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  69.63 
 
 
334 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  71.02 
 
 
333 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  69.33 
 
 
334 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  69.33 
 
 
334 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  69.33 
 
 
334 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  69.75 
 
 
331 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  68.5 
 
 
339 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  67.5 
 
 
336 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  68.1 
 
 
350 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  67.9 
 
 
326 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  68.42 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  63.44 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  67.52 
 
 
332 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  69.41 
 
 
326 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  68.17 
 
 
326 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  66.87 
 
 
326 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  64.97 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  66.56 
 
 
323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  66.67 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  65.83 
 
 
332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  61.47 
 
 
328 aa  434  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  63.7 
 
 
312 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  63.02 
 
 
312 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  63.7 
 
 
312 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  62.54 
 
 
309 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  61.97 
 
 
314 aa  414  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  64.53 
 
 
310 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  63.21 
 
 
310 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  62.16 
 
 
317 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  62.21 
 
 
317 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  62.21 
 
 
313 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  63.21 
 
 
310 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  62.42 
 
 
323 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  59.74 
 
 
314 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  58.17 
 
 
309 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  58.78 
 
 
306 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  58.72 
 
 
301 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  57.57 
 
 
309 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  56.44 
 
 
322 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  57.23 
 
 
315 aa  361  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  56.33 
 
 
305 aa  361  9e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  55.44 
 
 
305 aa  359  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  56 
 
 
308 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  54.79 
 
 
304 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  55.14 
 
 
302 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  56.21 
 
 
294 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  55.44 
 
 
299 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  52.94 
 
 
322 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  52.44 
 
 
316 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  54.67 
 
 
305 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  57.91 
 
 
313 aa  345  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  54.46 
 
 
319 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  52.09 
 
 
316 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  53.36 
 
 
311 aa  343  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  53.44 
 
 
317 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  54.3 
 
 
305 aa  335  7.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  51.63 
 
 
555 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  47.1 
 
 
320 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  49.5 
 
 
312 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  47.85 
 
 
327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  48.14 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  47.3 
 
 
319 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  47.24 
 
 
319 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  47.87 
 
 
310 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  53.75 
 
 
257 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  52.12 
 
 
254 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  46.38 
 
 
310 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  51.69 
 
 
254 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  53.36 
 
 
255 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  52.99 
 
 
242 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  50 
 
 
255 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  43.54 
 
 
269 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  47.7 
 
 
255 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  43.48 
 
 
310 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  42.43 
 
 
310 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  43.1 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  46.4 
 
 
275 aa  252  8.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  40.64 
 
 
623 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  43.73 
 
 
282 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 
275 aa  229  6e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  41.43 
 
 
346 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  43.17 
 
 
287 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  40 
 
 
274 aa  225  9e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  43.11 
 
 
334 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  42.75 
 
 
282 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  43.11 
 
 
284 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  41.15 
 
 
302 aa  220  3e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  42.45 
 
 
287 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  43.48 
 
 
284 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  42.39 
 
 
282 aa  219  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  42.86 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  42.86 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>