256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0359 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  293  7e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  72.48 
 
 		 149 aa  223  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  73.15 
 
 		 149 aa  222  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  48.3 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  44.83 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  45.58 
 
 		 149 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  46.26 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  45.58 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  45.21 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  46.58 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  44.83 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  46.9 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  44.83 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  44.14 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  47.59 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  46.9 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  44.22 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  45.83 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  47.59 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  46.31 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  47.59 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  46.9 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  46.9 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  44.9 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.47 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  46.21 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  46.21 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  43.06 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  43.15 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  46.21 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  45.95 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  46.21 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  41.38 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  44.52 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  42.76 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.69 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  48.97 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  48.97 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  45.52 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  39.58 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1099  GatB/Yqey domain-containing protein  44 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  40.69 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  43.45 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  40.97 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  44.83 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  38.62 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  45.33 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  44.22 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  42.07 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.07 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  46.9 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.58 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  43.75 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  40 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.97 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.85 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  43.45 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  40.69 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  43.06 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  42.25 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  44.22 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  44.14 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  41.33 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  45.33 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.58 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.37 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.35 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>