More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0336 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0336  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 525 aa  1078    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0816942  hitchhiker  0.0000000105658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0164  hypothetical protein  39.38 
 
 		 525 aa  326  6e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.156481  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0175  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  38.2 
 
 		 535 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  39.37 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1237  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.07 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.44 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.25 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.23 
 
 		 436 aa  133  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1551  cell cycle protein mesJ, putative  37.02 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.59 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  29.38 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  29.92 
 
 		 431 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  29.74 
 
 		 442 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03220  hypothetical protein  30.28 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.45 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1286  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.09 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.170507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2886  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.38 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664509  normal  0.0502291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  28.88 
 
 		 427 aa  120  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1842  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1497  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.38 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2619  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.6 
 
 		 474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1466  Fis family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1461  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.24 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1809  hypothetical protein  31.56 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2799  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.07 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.772923 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.02 
 
 		 440 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1442  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.95 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  32.07 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.88 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.2 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.13 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.28 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2962  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.08 
 
 		 448 aa  114  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1570  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  26.88 
 
 		 476 aa  114  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.38 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.38 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.38 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1155  cell cycle protein MesJ  26.76 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.27 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1645  cell cycle protein MesJ  29.45 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1136  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.25 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.807965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.83 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3036  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.39 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1118  hypothetical protein  29.14 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2692  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.27 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000485637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00186  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.93 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00185  hypothetical protein  27.93 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.434611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.99 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1364  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.42 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0258  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.81 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.921604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  32.56 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.14 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0277  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.43 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.24 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0181  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.86 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.95 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3472  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.86 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878016  normal  0.473347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3415  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.58 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1170  putative cell cycle protein  29.22 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1105  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.42 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340413  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.86 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0190  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.86 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0274  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.81 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.433905  normal  0.237659 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  26.95 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0263  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.14 
 
 		 430 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.144292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3147  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.97 
 
 		 442 aa  107  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0258  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.14 
 
 		 430 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.53 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38820  PP-loop-tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.6 
 
 		 435 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0580  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  29.39 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0306545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01899  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  30.81 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  29.12 
 
 		 326 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.62 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.52 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.867953  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1011  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.52 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.258759  normal  0.14023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2890  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.14 
 
 		 328 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  0.0327552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.57 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  27.38 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3145  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.1 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0165615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  28 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  27.53 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.53 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1125  PP-loop  30.54 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00891393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.84 
 
 		 476 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0726  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.46 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.238503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0103  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.64 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.74 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.84 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1501  hypothetical protein  28.7 
 
 		 439 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1673  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.65 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  26.6 
 
 		 476 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  26.75 
 
 		 476 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  26.75 
 
 		 476 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1352  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  28.44 
 
 		 320 aa  96.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.75 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  26.75 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3765  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.44 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000300868  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.92 
 
 		 464 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2510  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.74 
 
 		 319 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>