More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4731 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  98.63 
 
 
293 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  97.93 
 
 
290 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.31826e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  90.44 
 
 
297 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  73.72 
 
 
297 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  68.86 
 
 
293 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  68.26 
 
 
293 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  59.93 
 
 
299 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  64.51 
 
 
296 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  63.14 
 
 
296 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  50.86 
 
 
309 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  48.62 
 
 
297 aa  255  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  50.86 
 
 
305 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  50.52 
 
 
305 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.58 
 
 
297 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  45.33 
 
 
298 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  50.54 
 
 
305 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.12 
 
 
333 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  42.2 
 
 
298 aa  234  1e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  45.74 
 
 
296 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  49.12 
 
 
320 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  45.04 
 
 
296 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 
296 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  45.64 
 
 
296 aa  226  5e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  40.75 
 
 
305 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  39.38 
 
 
301 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.32961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  45.64 
 
 
296 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  43.24 
 
 
297 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  45.3 
 
 
296 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  40.43 
 
 
341 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  45.3 
 
 
296 aa  221  1e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  45.64 
 
 
295 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  45.3 
 
 
296 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.19 
 
 
297 aa  216  3e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.19 
 
 
297 aa  216  3e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  47.72 
 
 
302 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  47.02 
 
 
302 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  47.02 
 
 
302 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  36.14 
 
 
313 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  35.56 
 
 
303 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  35.42 
 
 
308 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  35.46 
 
 
312 aa  140  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 
291 aa  140  4e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.2 
 
 
331 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  35.31 
 
 
312 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  35.31 
 
 
312 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  35.31 
 
 
312 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  35.31 
 
 
312 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  35.31 
 
 
312 aa  135  6e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  35.31 
 
 
312 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  31.82 
 
 
297 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  32.37 
 
 
319 aa  135  1e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
305 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  32.41 
 
 
301 aa  132  8e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
305 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  34.74 
 
 
310 aa  132  1e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.29 
 
 
297 aa  128  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.62 
 
 
325 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
309 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
317 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
291 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  33.45 
 
 
315 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.82 
 
 
329 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.92 
 
 
294 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
301 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  8.02295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
310 aa  117  2e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.63 
 
 
306 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
307 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 
309 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.79 
 
 
311 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.93 
 
 
303 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.29 
 
 
303 aa  115  7e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.76936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.29 
 
 
303 aa  115  7e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.48571e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.99 
 
 
345 aa  115  9e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.29 
 
 
303 aa  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.93 
 
 
303 aa  114  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10425e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.92 
 
 
303 aa  114  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  32.19 
 
 
310 aa  114  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  30.03 
 
 
322 aa  114  1e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  31.05 
 
 
301 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.5 
 
 
293 aa  114  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.57 
 
 
303 aa  114  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.29 
 
 
303 aa  114  2e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.87 
 
 
303 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.57 
 
 
303 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30.18 
 
 
294 aa  113  4e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
300 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.24016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  112  8e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 
301 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  31.77 
 
 
310 aa  112  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  30.58 
 
 
309 aa  111  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  32.41 
 
 
324 aa  109  4e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  32.04 
 
 
300 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.96 
 
 
341 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 
312 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 
305 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
302 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  30.82 
 
 
300 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>