127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4710 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  97.91 
 
 		 239 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  89.12 
 
 		 239 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  85.77 
 
 		 239 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  81.25 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  72.88 
 
 		 246 aa  357  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  71.19 
 
 		 246 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  68.3 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  69.2 
 
 		 242 aa  315  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  64.56 
 
 		 243 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  64.56 
 
 		 243 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  64.14 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  64.98 
 
 		 243 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  64.1 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  64.53 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  64.1 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  64.14 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  65.5 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  65.5 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  61.11 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  64.14 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  59.32 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  41.91 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  42.32 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  43.64 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  42.37 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  43.53 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  43.15 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  44.17 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  40.87 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  44.17 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  43.56 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  42.34 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  45.78 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  40.25 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  38.94 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  39.83 
 
 		 252 aa  151  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  44.26 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  43.24 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  40.09 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  38.03 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  40.29 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  41.98 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  39.91 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  41.81 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  41.81 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  38.08 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  39.04 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  42.44 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  40.93 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  41 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  38.77 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  37.82 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  40.27 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  41.59 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  40.24 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  40.17 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  40.77 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  37.14 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  42.29 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  36.04 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  39.52 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  36.04 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  40.41 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  40.89 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  39.74 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  39.74 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  37.18 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  38.89 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  36.16 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  43.05 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  35.71 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  39.82 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  38.84 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  36.4 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  35.29 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  36.62 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  36.49 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  33.81 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  30.73 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  31.5 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  25.91 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  25.1 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  28.93 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  26.59 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  32.55 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  26.59 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  23.91 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  26.67 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  27.46 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  30.05 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  30 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>