250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5072 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80.5 
 
 		 475 aa  716    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  98.95 
 
 		 478 aa  946    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  88.66 
 
 		 478 aa  826    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  76.86 
 
 		 486 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.88 
 
 		 487 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.98 
 
 		 484 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  87.71 
 
 		 484 aa  833    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.4 
 
 		 484 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  87.5 
 
 		 484 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.48 
 
 		 486 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.64 
 
 		 489 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6083  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.13 
 
 		 490 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.8 
 
 		 488 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.81 
 
 		 491 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  79.87 
 
 		 475 aa  707    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2826  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.32 
 
 		 491 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0309139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.8 
 
 		 488 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.69 
 
 		 489 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.89 
 
 		 486 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  76.6 
 
 		 607 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  90.34 
 
 		 477 aa  831    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  98.74 
 
 		 478 aa  944    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3788  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.6 
 
 		 484 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.6 
 
 		 484 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.4 
 
 		 484 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  86.34 
 
 		 478 aa  802    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0338  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.57 
 
 		 474 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4544  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  82.56 
 
 		 474 aa  710    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  74.49 
 
 		 484 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.05 
 
 		 483 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3571  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.52 
 
 		 473 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  77.53 
 
 		 490 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.98 
 
 		 484 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01840  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  82.95 
 
 		 477 aa  739    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0883663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.6 
 
 		 484 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3300  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80.46 
 
 		 474 aa  698    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  98.95 
 
 		 478 aa  946    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  82.14 
 
 		 474 aa  740    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  88.87 
 
 		 478 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.57 
 
 		 484 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.4 
 
 		 484 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.98 
 
 		 484 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.4 
 
 		 484 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.49 
 
 		 484 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 		 476 aa  952    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3798  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  81.93 
 
 		 474 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3951  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  80.46 
 
 		 474 aa  698    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.4 
 
 		 484 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4750  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  79.92 
 
 		 477 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  67.58 
 
 		 455 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67.16 
 
 		 455 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  65.55 
 
 		 459 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.28 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.79 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  58.7 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.42 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.84 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.59 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.59 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.79 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.58 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.49 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.91 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.19 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.11 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.08 
 
 		 465 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  60.68 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.84 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.96 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  57.98 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.58 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.65 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.32 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1950  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.75 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0105538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.05 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.02 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.81 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.17 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.65 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.17 
 
 		 467 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.16 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.68 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  54.43 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.24 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  54.22 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.24 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1181  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.26 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3253  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.74 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  52.39 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.84 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2884  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.16 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.83 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.78 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.6 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.6 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.6 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  50 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.451295 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.05 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1417  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.74 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.2 
 
 		 494 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>