250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3540 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1950  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.82 
 
 
468 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0105538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.32 
 
 
464 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.42 
 
 
466 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  78.28 
 
 
465 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.68 
 
 
464 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  72.9 
 
 
465 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.9 
 
 
466 aa  668    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
465 aa  917    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.99 
 
 
466 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  74.19 
 
 
467 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.67 
 
 
466 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  78.28 
 
 
465 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  73.82 
 
 
466 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3253  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.35 
 
 
467 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  74.19 
 
 
465 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.08 
 
 
468 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  73.71 
 
 
465 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.68 
 
 
467 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.9 
 
 
466 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  78.28 
 
 
465 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.42 
 
 
466 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  69.94 
 
 
472 aa  634  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2884  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.75 
 
 
466 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1417  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  74.19 
 
 
467 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857148  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.45 
 
 
464 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.03 
 
 
467 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.33 
 
 
470 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  67.8 
 
 
493 aa  591  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  70.78 
 
 
472 aa  588  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.38 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1181  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.91 
 
 
472 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2549  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.71 
 
 
467 aa  544  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.859449  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3571  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.73 
 
 
473 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  61.75 
 
 
465 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  61.54 
 
 
465 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.14 
 
 
486 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.97 
 
 
474 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  59.54 
 
 
478 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.21 
 
 
484 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4544  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.16 
 
 
474 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  59.12 
 
 
478 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.94 
 
 
486 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3798  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.13 
 
 
474 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.8 
 
 
484 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.44 
 
 
488 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.44 
 
 
488 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.91 
 
 
489 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.38 
 
 
477 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.18 
 
 
484 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.71 
 
 
478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.73 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.08 
 
 
476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.73 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.73 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.42 
 
 
475 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.53 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.14 
 
 
484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.73 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.73 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.71 
 
 
478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.42 
 
 
475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.73 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0338  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.47 
 
 
474 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  57.73 
 
 
607 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.5 
 
 
478 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.88 
 
 
483 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.09 
 
 
491 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  57.94 
 
 
486 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  57.56 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.44 
 
 
478 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2826  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.8 
 
 
491 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0309139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01840  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.07 
 
 
477 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0883663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.76 
 
 
484 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.44 
 
 
489 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.21 
 
 
455 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.21 
 
 
455 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4750  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.61 
 
 
477 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6083  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.32 
 
 
490 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.2 
 
 
484 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.11 
 
 
487 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.41 
 
 
484 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.2 
 
 
484 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3788  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.79 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.82 
 
 
484 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.33 
 
 
482 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  54.7 
 
 
464 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  54.82 
 
 
458 aa  481  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  54.7 
 
 
464 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  53.91 
 
 
494 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  54.7 
 
 
464 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  55.49 
 
 
469 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.12 
 
 
470 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3300  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.3 
 
 
474 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.03 
 
 
465 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  52.11 
 
 
494 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  52.11 
 
 
494 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  52.11 
 
 
494 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3951  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.3 
 
 
474 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372135  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.27 
 
 
462 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  54.24 
 
 
464 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>