More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0337 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  100 
 
 
351 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  57.44 
 
 
447 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  56.29 
 
 
457 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  54.79 
 
 
457 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  55.59 
 
 
457 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  55.59 
 
 
457 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  55.59 
 
 
457 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  55.59 
 
 
457 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  54.68 
 
 
457 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  57.23 
 
 
445 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  49.22 
 
 
447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  50.93 
 
 
454 aa  318  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  50.93 
 
 
449 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  50.87 
 
 
449 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  49.38 
 
 
454 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  45.2 
 
 
454 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  42.99 
 
 
455 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  46.69 
 
 
452 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  48.59 
 
 
447 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  44.62 
 
 
452 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  43.75 
 
 
447 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  38.21 
 
 
452 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  39.42 
 
 
463 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  43.49 
 
 
465 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  37.79 
 
 
444 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  42.59 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  41.06 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  42.9 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  39.69 
 
 
468 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  41.49 
 
 
463 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  39.81 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  39.69 
 
 
469 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  39.26 
 
 
468 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  38.12 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  38.85 
 
 
453 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  36.05 
 
 
449 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  37.08 
 
 
460 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  39.38 
 
 
450 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  38.39 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  36.87 
 
 
465 aa  226  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  36.87 
 
 
465 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  36.96 
 
 
456 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  37.02 
 
 
463 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  38.77 
 
 
442 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  33.82 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  36.31 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  35.56 
 
 
460 aa  222  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  36.2 
 
 
446 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  34.48 
 
 
458 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  38.48 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  36.86 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  36.36 
 
 
450 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  34.99 
 
 
443 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  41.36 
 
 
486 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  38.18 
 
 
454 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  37.89 
 
 
451 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  39.64 
 
 
438 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  40.56 
 
 
462 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  41.98 
 
 
486 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  35.56 
 
 
447 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  36.14 
 
 
458 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  40.56 
 
 
462 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  36.5 
 
 
446 aa  215  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  39.25 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  36.78 
 
 
460 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  35.03 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  36.67 
 
 
460 aa  212  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  37.58 
 
 
463 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  35.45 
 
 
460 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  35 
 
 
457 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  36.11 
 
 
461 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  36.54 
 
 
454 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  36.11 
 
 
461 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  38.15 
 
 
461 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  36.18 
 
 
460 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  34.71 
 
 
457 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  31.7 
 
 
454 aa  206  4e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  39.19 
 
 
441 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  35.76 
 
 
460 aa  206  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  36.78 
 
 
460 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.17 
 
 
461 aa  205  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  41.67 
 
 
471 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  38.12 
 
 
449 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  38.9 
 
 
441 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  38.9 
 
 
441 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  40 
 
 
460 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  37.81 
 
 
444 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  38.46 
 
 
473 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  34.24 
 
 
458 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  34.64 
 
 
456 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  39.23 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  36.02 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  34.14 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  38.79 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  34.74 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  35.94 
 
 
465 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.02 
 
 
453 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  35.33 
 
 
447 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  34.25 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  34.63 
 
 
458 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>