More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4910 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.31826e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  98.62 
 
 
293 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  97.93 
 
 
293 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  91.03 
 
 
297 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  73.1 
 
 
297 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  68.86 
 
 
293 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  69.55 
 
 
293 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  66.2 
 
 
296 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  59.86 
 
 
299 aa  335  4e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  64.44 
 
 
296 aa  319  4e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  51.38 
 
 
309 aa  274  1e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  48.97 
 
 
297 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  51.72 
 
 
305 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  45.67 
 
 
298 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  51.38 
 
 
305 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.23 
 
 
297 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  51.61 
 
 
305 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.31 
 
 
333 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  41.84 
 
 
298 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.69 
 
 
296 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  45.39 
 
 
296 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  45.99 
 
 
296 aa  225  5e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  44.68 
 
 
296 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  48.77 
 
 
320 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  45.3 
 
 
296 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  45.3 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  45.99 
 
 
296 aa  222  5e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  40.43 
 
 
341 aa  221  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  43.51 
 
 
297 aa  221  1e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  40.78 
 
 
305 aa  221  1e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  39.72 
 
 
301 aa  220  2e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.32961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  45.99 
 
 
295 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  45.99 
 
 
296 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.82 
 
 
297 aa  214  2e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.82 
 
 
297 aa  214  2e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  47.37 
 
 
302 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  46.67 
 
 
302 aa  197  1e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  46.67 
 
 
302 aa  197  1e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  35.44 
 
 
313 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  35.21 
 
 
303 aa  152  6e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  35.9 
 
 
308 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.2 
 
 
331 aa  139  8e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
291 aa  136  3e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  33.09 
 
 
319 aa  135  6e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  35.11 
 
 
312 aa  134  1e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  31.71 
 
 
297 aa  130  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
305 aa  130  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  34.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  34.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  34.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  34.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  34.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  34.97 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
305 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  34.39 
 
 
310 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.29 
 
 
297 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  31.38 
 
 
301 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
291 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 
309 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 
317 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  119  4e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.93 
 
 
325 aa  120  4e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.82 
 
 
329 aa  119  5e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  33.79 
 
 
315 aa  117  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  32.49 
 
 
310 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
301 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  8.02295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.63 
 
 
306 aa  115  7e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
310 aa  114  2e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.64 
 
 
303 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.48571e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.64 
 
 
303 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.76936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.64 
 
 
303 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.27 
 
 
303 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.58 
 
 
303 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.29 
 
 
303 aa  112  7e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.64 
 
 
303 aa  112  8e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.29 
 
 
303 aa  112  8e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10425e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
300 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.24016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
307 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  32.99 
 
 
310 aa  111  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  32.63 
 
 
299 aa  112  1e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.69 
 
 
301 aa  111  1e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 
309 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.63 
 
 
293 aa  110  2e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  30.03 
 
 
322 aa  111  2e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.63 
 
 
345 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.11 
 
 
311 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.57 
 
 
303 aa  108  8e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
312 aa  108  9e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  32.27 
 
 
300 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.57 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.86 
 
 
309 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  29.82 
 
 
294 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 
305 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.6 
 
 
302 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
302 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  31.9 
 
 
300 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 
301 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  31.71 
 
 
324 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.24 
 
 
341 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>