62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3330 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  100 
 
 		 407 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  53.06 
 
 		 427 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  52.81 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  53.19 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  47.87 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  46.52 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  46.52 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  46.52 
 
 		 410 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  46.36 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  46.36 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  46.36 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  43.73 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  40.37 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  34.14 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  34.92 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  34.92 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  34.24 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  34.62 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  35.01 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  36.1 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  33.15 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  31.99 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  33.24 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  31.61 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  31.86 
 
 		 346 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  30.71 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  37.22 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  30.06 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  30.45 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  45.65 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  28.61 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  27.99 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  28.91 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  30.58 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  35.09 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  28.94 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  36.77 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  24.87 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  26.32 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  35.26 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  35.26 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  35.26 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  35.33 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  28.7 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  30.81 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  23.6 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  34.74 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  31.85 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  30.22 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  34 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  28.95 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  30.22 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  36.99 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  29.47 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  29.5 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  29.71 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  28.69 
 
 		 424 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  28.69 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  29.84 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  32.35 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>