More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1444 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
280 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  49.82 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.97 
 
 
283 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.37 
 
 
284 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.63 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  36.46 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.38 
 
 
282 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.57 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.09 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.56 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  34.46 
 
 
499 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.04 
 
 
281 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  33.76 
 
 
496 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.89 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1322  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.04 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  34.03 
 
 
492 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  30.25 
 
 
484 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  34.03 
 
 
289 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.95 
 
 
484 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.56 
 
 
484 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.86 
 
 
512 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.4 
 
 
292 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.29 
 
 
295 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.22 
 
 
287 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.69 
 
 
484 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.61 
 
 
492 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.93 
 
 
506 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  30 
 
 
490 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  32.57 
 
 
484 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.46 
 
 
468 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.13 
 
 
479 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.8 
 
 
492 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  31.15 
 
 
484 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.85 
 
 
496 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  32.49 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.55 
 
 
507 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.49 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.39 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.58 
 
 
467 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.77 
 
 
514 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.51 
 
 
488 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.15 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.97 
 
 
450 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  31.15 
 
 
493 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.6 
 
 
530 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.04 
 
 
480 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.51 
 
 
481 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  34.04 
 
 
543 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.47 
 
 
515 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  32.62 
 
 
484 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.64 
 
 
507 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.01 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.96 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.53 
 
 
488 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.57 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  30.83 
 
 
480 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.6 
 
 
507 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  32.21 
 
 
294 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.15 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.43 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.89 
 
 
484 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.57 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.83 
 
 
487 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.8 
 
 
505 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  31.38 
 
 
500 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  28.78 
 
 
292 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.78 
 
 
292 aa  92  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.78 
 
 
292 aa  92  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  27.92 
 
 
280 aa  92  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.78 
 
 
292 aa  92  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  28.78 
 
 
292 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  31.9 
 
 
484 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.78 
 
 
292 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.86 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.04 
 
 
512 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0728  FAD-binding protein, putative  29.51 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  36.29 
 
 
845 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.78 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.66 
 
 
542 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0193  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.31 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.97 
 
 
292 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.939597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1291  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.97 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3561  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.6 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  32.33 
 
 
496 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.38 
 
 
527 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.14 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  30 
 
 
467 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.38 
 
 
520 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.67 
 
 
501 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.54 
 
 
516 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  30.31 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  32.19 
 
 
485 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.96 
 
 
526 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.52 
 
 
504 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.54 
 
 
528 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.54 
 
 
523 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  30.54 
 
 
528 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0643  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.14 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.05 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  29.64 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>