47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0511 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  100 
 
 
330 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  65.55 
 
 
350 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  64.94 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  61.28 
 
 
342 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  64.63 
 
 
342 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  54.84 
 
 
317 aa  325  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  37.14 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  40.88 
 
 
397 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  35.73 
 
 
399 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  35.04 
 
 
422 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  35.82 
 
 
315 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  35.53 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  34.67 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  34.53 
 
 
322 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  34.56 
 
 
392 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  39.47 
 
 
503 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  34.97 
 
 
493 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  33.74 
 
 
364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  39.75 
 
 
494 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  39.75 
 
 
494 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  31.53 
 
 
369 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  33.54 
 
 
550 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  33.23 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  34.37 
 
 
369 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  41.08 
 
 
493 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  32.9 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  32.5 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  31.48 
 
 
378 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  38.42 
 
 
491 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  32.44 
 
 
379 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  30.79 
 
 
383 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  35.94 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  36.32 
 
 
499 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  34.58 
 
 
326 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  32.3 
 
 
368 aa  96.3  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  31.37 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  32.07 
 
 
505 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  27.83 
 
 
423 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  30.1 
 
 
493 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  33.48 
 
 
499 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  30.36 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  30.36 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  29.03 
 
 
420 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  28.08 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  28.5 
 
 
504 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  27.4 
 
 
684 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  27.57 
 
 
834 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>