23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0273 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  100 
 
 		 342 aa  702    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  43.97 
 
 		 552 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  43.26 
 
 		 552 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  40.15 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  35.46 
 
 		 195 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  43.36 
 
 		 585 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  31.29 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  26.81 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  26.09 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  27.54 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  27.46 
 
 		 942 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  24.66 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  25.35 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  21.99 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  29.29 
 
 		 851 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  38.64 
 
 		 1868 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  27.03 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  29.09 
 
 		 250 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  26.36 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  20.8 
 
 		 135 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6503  TIR protein  29.36 
 
 		 641 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.985723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  26.35 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>