12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6503 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6503  TIR protein  100 
 
 		 641 aa  1313    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.985723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0200  hypothetical protein  40.69 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.811738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3632  hypothetical protein  27.97 
 
 		 481 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.454242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1219  hypothetical protein  33.93 
 
 		 773 aa  136  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000629207  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2382  hypothetical protein  39.09 
 
 		 767 aa  135  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3776  hypothetical protein  30.94 
 
 		 745 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.94629  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3532  hypothetical protein  32.51 
 
 		 793 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0553  hypothetical protein  22.03 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.513791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2031  AAA ATPase  31.45 
 
 		 1150 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000206232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0485  hypothetical protein  27.91 
 
 		 743 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212025  normal  0.046146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  29.36 
 
 		 342 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0118  hypothetical protein  24.24 
 
 		 337 aa  43.9  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>