24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1148 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  27.13 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  27.72 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  24.04 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  26.11 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  27.02 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  23.35 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  27.95 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  27.84 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  27.72 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.1 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  28.02 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  24.88 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  26.18 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  23.59 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  24.62 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  28.7 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  24.67 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  23.7 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  26.61 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  23.78 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  23.41 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>