More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2569 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.19 
 
 
239 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.25 
 
 
238 aa  345  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.25 
 
 
238 aa  345  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.25 
 
 
238 aa  345  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.52 
 
 
238 aa  344  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.62 
 
 
240 aa  339  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.83 
 
 
238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68 
 
 
243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.52 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.52 
 
 
242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.45 
 
 
243 aa  287  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  62.61 
 
 
242 aa  287  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.61 
 
 
243 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.87 
 
 
243 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.01 
 
 
242 aa  284  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.01 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.01 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.01 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.57 
 
 
243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.01 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.01 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.01 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  61.57 
 
 
242 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  61.57 
 
 
242 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  61.57 
 
 
242 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  61.57 
 
 
242 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  65.95 
 
 
243 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.33 
 
 
233 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  61.61 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 
246 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  57.98 
 
 
262 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.4 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 
230 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.91 
 
 
246 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.19 
 
 
265 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.45 
 
 
253 aa  221  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.83 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.98 
 
 
304 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.42 
 
 
303 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.42 
 
 
303 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  50.44 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.12 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.34 
 
 
237 aa  209  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 
301 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.11 
 
 
263 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  50.68 
 
 
301 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
299 aa  205  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.33 
 
 
303 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.09 
 
 
355 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.57 
 
 
242 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.37 
 
 
262 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 
286 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.39 
 
 
307 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.02 
 
 
247 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.23 
 
 
201 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.32 
 
 
241 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.89 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  46.48 
 
 
254 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.86 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  45.92 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.48 
 
 
254 aa  178  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 
249 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 
249 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.21 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.24 
 
 
266 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.35 
 
 
253 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.19 
 
 
238 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0220  putative transport-related membrane protein  43.61 
 
 
221 aa  168  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.95 
 
 
250 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.08 
 
 
300 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.75 
 
 
222 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0756  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.11 
 
 
217 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.64 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
222 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.06 
 
 
240 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
222 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
222 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
222 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.63 
 
 
214 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.93 
 
 
237 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
222 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
222 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.33 
 
 
273 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
222 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.1 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
222 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
219 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.39 
 
 
235 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.95 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.95 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.95 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.95 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.95 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>