22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1401 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
232 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  34.07 
 
 
220 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  32.75 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  32.75 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  30.49 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  25.79 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  25.26 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  26.9 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  26.88 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  23.85 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  24.62 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1857  type IV pilus assembly PilZ  27.38 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  24.06 
 
 
321 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0656  hypothetical protein  25.2 
 
 
347 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  22.02 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  22.22 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  24.89 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  23.35 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  25.55 
 
 
293 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1312  type IV pilus assembly PilZ  24.64 
 
 
227 aa  42  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.244718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>