More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1378 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
743 aa  1499    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
722 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  39.17 
 
 
701 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
701 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.56 
 
 
198 aa  294  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
268 aa  251  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.67 
 
 
406 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.33 
 
 
332 aa  225  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.766568  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
273 aa  219  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
285 aa  217  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
297 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  43.12 
 
 
272 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
272 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  43.64 
 
 
273 aa  198  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
286 aa  195  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
270 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
297 aa  194  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
270 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
281 aa  191  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
279 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
272 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  39.82 
 
 
277 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  41.63 
 
 
269 aa  189  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
298 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 
277 aa  187  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
299 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
277 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
296 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
299 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
272 aa  185  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
310 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
390 aa  184  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
301 aa  183  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
301 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
307 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
280 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
299 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
303 aa  180  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
278 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
275 aa  178  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
281 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
299 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.09 
 
 
278 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
278 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
277 aa  177  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
283 aa  177  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
299 aa  177  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  42.73 
 
 
273 aa  176  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
271 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
279 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
271 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
273 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  38.46 
 
 
315 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
271 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
324 aa  175  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
300 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.83 
 
 
279 aa  174  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
274 aa  174  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
273 aa  173  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0449998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
273 aa  173  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
315 aa  173  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.74 
 
 
302 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
311 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
288 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  38.91 
 
 
277 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  38.74 
 
 
280 aa  172  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
280 aa  172  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.1 
 
 
277 aa  172  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
290 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
268 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
277 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
295 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
276 aa  171  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  38.46 
 
 
286 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  33.87 
 
 
308 aa  170  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
285 aa  170  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
275 aa  170  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.53 
 
 
275 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
294 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.32 
 
 
293 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
285 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
273 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.37 
 
 
295 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
291 aa  169  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
276 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0775264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
277 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.390959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
279 aa  168  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
275 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
294 aa  168  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
282 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
349 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59414  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
381 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
271 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
292 aa  167  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.62 
 
 
276 aa  167  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
275 aa  167  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
275 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
291 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
349 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.470539 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
279 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>