43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0563 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  310  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  33.79 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  33.79 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  31.94 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  31.94 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  36.04 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  31.94 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.56 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  32.14 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  26.87 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  30.99 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  32.17 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  25.34 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  40.74 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  40.74 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3991  hypothetical protein  35.14 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  25.58 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  27.94 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  30.43 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  24.58 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  31.45 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  23.49 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  27.52 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  26.24 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  31.4 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  26.27 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  26.4 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  25.35 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  25.95 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.53 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  22.37 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  26.27 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  23.03 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>