More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2313 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  68.39 
 
 		 1032 aa  1369    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  68.8 
 
 		 1032 aa  1373    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  100 
 
 		 1018 aa  2066    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  39.47 
 
 		 671 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  38.12 
 
 		 653 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  38.19 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  37.98 
 
 		 656 aa  419  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  37.03 
 
 		 653 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  37.2 
 
 		 663 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 		 659 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 665 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  34.7 
 
 		 632 aa  335  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  33.49 
 
 		 631 aa  297  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  33.49 
 
 		 631 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.54 
 
 		 629 aa  288  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  31.5 
 
 		 640 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  31.42 
 
 		 634 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  49.8 
 
 		 896 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  47.1 
 
 		 494 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  28.55 
 
 		 702 aa  219  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  46.99 
 
 		 468 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 		 569 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 		 571 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  45.76 
 
 		 599 aa  208  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 		 776 aa  207  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  40.35 
 
 		 604 aa  207  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 		 666 aa  207  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 		 646 aa  206  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.31 
 
 		 584 aa  205  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.13 
 
 		 520 aa  205  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 		 585 aa  205  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.73 
 
 		 645 aa  204  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 		 642 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.91 
 
 		 650 aa  203  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 		 673 aa  202  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  41.36 
 
 		 612 aa  202  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 		 502 aa  202  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  41.04 
 
 		 625 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.03 
 
 		 598 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.8 
 
 		 863 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.89 
 
 		 627 aa  198  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.21 
 
 		 579 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 		 632 aa  197  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.21 
 
 		 916 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.13 
 
 		 662 aa  197  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  38.41 
 
 		 672 aa  196  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 520 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  43.38 
 
 		 646 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.07 
 
 		 632 aa  196  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.42 
 
 		 681 aa  195  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.83 
 
 		 652 aa  195  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  41.84 
 
 		 1053 aa  194  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 		 618 aa  194  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.16 
 
 		 880 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 		 729 aa  194  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  41.67 
 
 		 617 aa  193  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 		 624 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.15 
 
 		 658 aa  192  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 		 624 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 		 624 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 746 aa  192  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.59 
 
 		 681 aa  192  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.9 
 
 		 692 aa  191  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.41 
 
 		 602 aa  191  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 		 612 aa  191  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 		 703 aa  191  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.16 
 
 		 648 aa  190  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 		 625 aa  190  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1535  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.86 
 
 		 515 aa  190  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  39.69 
 
 		 638 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.78 
 
 		 607 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  43.49 
 
 		 457 aa  189  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  39.22 
 
 		 618 aa  189  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  39 
 
 		 662 aa  189  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 		 439 aa  188  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.94 
 
 		 627 aa  187  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.26 
 
 		 528 aa  187  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  40 
 
 		 1057 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  41.89 
 
 		 519 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.33 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 		 381 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  36.99 
 
 		 667 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 		 419 aa  185  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.4 
 
 		 664 aa  185  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.64 
 
 		 647 aa  184  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  41.35 
 
 		 825 aa  184  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.22 
 
 		 681 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.82 
 
 		 623 aa  184  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  44.91 
 
 		 621 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 		 690 aa  184  9.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  39.63 
 
 		 621 aa  184  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 		 636 aa  184  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  39.38 
 
 		 626 aa  184  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 		 623 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.96 
 
 		 1373 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  42.38 
 
 		 531 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  39.63 
 
 		 623 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  39.77 
 
 		 625 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  39.77 
 
 		 625 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>