18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0900 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1287    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  66.5 
 
 		 634 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  33.48 
 
 		 653 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  33.73 
 
 		 663 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  34.03 
 
 		 632 aa  327  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  33.49 
 
 		 653 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  34.2 
 
 		 656 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 		 651 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  33.8 
 
 		 1032 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 665 aa  293  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  31.55 
 
 		 671 aa  293  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  33.18 
 
 		 1032 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  32.87 
 
 		 631 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.8 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  33.18 
 
 		 631 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 		 659 aa  279  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  31.5 
 
 		 1018 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 702 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>