18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2874 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  100 
 
 		 653 aa  1341    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  60.37 
 
 		 659 aa  793    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  61.67 
 
 		 656 aa  812    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  60.3 
 
 		 651 aa  798    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  95.56 
 
 		 663 aa  1246    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  49.3 
 
 		 653 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  39.32 
 
 		 1032 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  39.17 
 
 		 1032 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  38.2 
 
 		 632 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  37.33 
 
 		 1018 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  33.95 
 
 		 640 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  35.19 
 
 		 671 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  32.73 
 
 		 634 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  32.1 
 
 		 631 aa  327  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  31.64 
 
 		 631 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.79 
 
 		 629 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 702 aa  244  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>