19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3417 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  95.79 
 
 		 631 aa  1157    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  95.79 
 
 		 631 aa  1182    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  100 
 
 		 629 aa  1251    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 665 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  35.35 
 
 		 656 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  34.11 
 
 		 653 aa  339  9e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  31.93 
 
 		 663 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  32.53 
 
 		 653 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 		 651 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  34.09 
 
 		 632 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  33.12 
 
 		 1032 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 659 aa  296  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  32.81 
 
 		 1032 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  33.54 
 
 		 1018 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  33.7 
 
 		 640 aa  292  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  32.7 
 
 		 634 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  30.47 
 
 		 671 aa  273  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 349 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>