28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2311 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  775    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  65.41 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  65.91 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  45.99 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  38.75 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  39.75 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  36.16 
 
 		 410 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  36.91 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  35.91 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  36.91 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  35.26 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  33.24 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  35.42 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  33.86 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  35.58 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  31.82 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  36.92 
 
 		 609 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.23 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 792 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1090 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  27.86 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.08 
 
 		 439 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  26.62 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 759 aa  43.1  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>