More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2761 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  100 
 
 		 139 aa  286  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  71.22 
 
 		 140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  72.86 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  71.53 
 
 		 137 aa  206  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  74.05 
 
 		 138 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  73.38 
 
 		 142 aa  205  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  72.46 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  71.74 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  76.74 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  76.61 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  71.74 
 
 		 138 aa  201  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  70.5 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  75.81 
 
 		 143 aa  199  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  74.05 
 
 		 137 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  71.94 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  76.74 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  72.52 
 
 		 136 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  68.84 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  74.19 
 
 		 141 aa  196  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  68.12 
 
 		 138 aa  196  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  69.78 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  74.4 
 
 		 142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  74.4 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  74.19 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  74.4 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  68.12 
 
 		 138 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  72.58 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  74.19 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  72.58 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  73.39 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  68.18 
 
 		 136 aa  186  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  72.58 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  73.39 
 
 		 140 aa  185  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  72.58 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  71.77 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  63.31 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  66.19 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  63.5 
 
 		 141 aa  176  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  53.9 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  63.11 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  59.4 
 
 		 129 aa  154  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  64.41 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  62.71 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  62.71 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  58.59 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  61.98 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  61.02 
 
 		 132 aa  149  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  62.71 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  60.48 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  61.98 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  59.23 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  55.38 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  61.16 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  61.16 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  61.67 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 178 aa  147  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  61.02 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  58.59 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  61.16 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>