More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2234 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2234  ATPase  100 
 
 		 349 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  72.81 
 
 		 333 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  71.6 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  71.03 
 
 		 337 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  72.96 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.16 
 
 		 334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  67.27 
 
 		 334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  70.4 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.78 
 
 		 333 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  69.47 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  68.83 
 
 		 336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  68.85 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.87 
 
 		 336 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  67.6 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  67.92 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  67.92 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  67.3 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  66.27 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.27 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.36 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  66.77 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  66.24 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  65.34 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  67.74 
 
 		 337 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.81 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  59.52 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.54 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.93 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  66.36 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  64.49 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  60.06 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  62.8 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  62.2 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  62.2 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  64.14 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  62.11 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  65.18 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  50.77 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  51.49 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.81 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.05 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.25 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.85 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  49.54 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.32 
 
 		 320 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  52.33 
 
 		 321 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.46 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  50.76 
 
 		 338 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  51.68 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.66 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 		 341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 		 334 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.24 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.13 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  47.6 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.93 
 
 		 345 aa  295  7e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  48.36 
 
 		 324 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  47.7 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  48.03 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.6 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.35 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.2 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  43.2 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.73 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  47.06 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  43.81 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  46.84 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.96 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.78 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  42.72 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  41.08 
 
 		 315 aa  262  8e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  45.7 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  40.31 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.06 
 
 		 324 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  43.09 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.37 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.95 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  38.81 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  43.49 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.24 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.22 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  40.13 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.59 
 
 		 317 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  40.45 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  39.94 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  44.88 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.75 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  44.74 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  40.51 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.08 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.63 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  42.11 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  42.38 
 
 		 316 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.39 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  40 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>