More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1743 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  100 
 
 		 419 aa  849    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  69.58 
 
 		 423 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  69.58 
 
 		 423 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  69.81 
 
 		 423 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  69.58 
 
 		 424 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  70.81 
 
 		 406 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  67.15 
 
 		 417 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  68.87 
 
 		 424 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  71.22 
 
 		 405 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2504  aspartate kinase  68.63 
 
 		 424 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3957  aspartate kinase  68.63 
 
 		 424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3818  aspartate kinase  68.74 
 
 		 419 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0379  aspartate kinase  66.51 
 
 		 417 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  66.75 
 
 		 411 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  68.09 
 
 		 419 aa  549  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0472  aspartate kinase  66.27 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7602  aspartate kinase  66.83 
 
 		 418 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  65.87 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0077  aspartate kinase  66.75 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.0840427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0099  aspartate kinase  66.98 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.211168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  65.55 
 
 		 411 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0514  aspartate kinase  66.27 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0514405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  65.07 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  65.55 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0891  aspartate kinase  64.92 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0896  aspartate kinase  65.55 
 
 		 411 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  65.55 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  63.92 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0958  aspartate kinase  65.31 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859872  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0608  aspartate kinase  66.98 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  61.67 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  62.38 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  62.59 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3304  aspartate kinase  61.23 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0250326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0636  aspartate kinase  60.8 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1849  aspartate kinase  60.33 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0498  aspartate kinase  60.33 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366794  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2144  aspartate kinase  61.47 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0884042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0862  aspartate kinase  59.39 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  59.38 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  57.45 
 
 		 405 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  56.25 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  56.01 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  56.49 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  57.28 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  54.5 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  54.74 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  54.18 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  56.49 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  55.85 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  55.13 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  55.85 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  54.65 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  54.65 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  52.97 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  55.37 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  54.42 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  54.81 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  54.65 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  54.65 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  52.87 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  55.74 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  54.29 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  54.18 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  53.24 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  54.61 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  54.42 
 
 		 411 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  54.42 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  54.52 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  52.15 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  52.49 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  54.37 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  54.27 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  53.85 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  55.76 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  55.56 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  55.19 
 
 		 453 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  55.16 
 
 		 406 aa  421  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  53.7 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  55.74 
 
 		 412 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  53.98 
 
 		 400 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  52.66 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  53.19 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  51.42 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  55.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  54.18 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  52.52 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  52.28 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  54.65 
 
 		 416 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  54.42 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  54.18 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  53.49 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  55.13 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  53 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>