More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3957 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3818  aspartate kinase  91.87 
 
 		 419 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  87.47 
 
 		 423 aa  751    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  87.71 
 
 		 423 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  87.71 
 
 		 423 aa  768    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  92.2 
 
 		 424 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  77.07 
 
 		 417 aa  671    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2504  aspartate kinase  92.22 
 
 		 424 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  87 
 
 		 424 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3957  aspartate kinase  100 
 
 		 424 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  70.96 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  68.63 
 
 		 419 aa  581  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  67.53 
 
 		 411 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  67.76 
 
 		 411 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  68.63 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  68.24 
 
 		 411 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0077  aspartate kinase  70.33 
 
 		 417 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.0840427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0099  aspartate kinase  70.79 
 
 		 417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.211168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0472  aspartate kinase  68.15 
 
 		 417 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179406  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  67.53 
 
 		 411 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0896  aspartate kinase  68 
 
 		 411 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7602  aspartate kinase  68.6 
 
 		 418 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0958  aspartate kinase  67.53 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859872  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0379  aspartate kinase  67.52 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0608  aspartate kinase  70.79 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0891  aspartate kinase  66.59 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0514  aspartate kinase  69.39 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0514405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  65.33 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  65.8 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  61.85 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  59.48 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  61.12 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3304  aspartate kinase  60.56 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0250326  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  60.42 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0862  aspartate kinase  61.11 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  60.19 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0636  aspartate kinase  59.82 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  59.91 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1849  aspartate kinase  59.82 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0498  aspartate kinase  59.82 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366794  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2144  aspartate kinase  59.15 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0884042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  52.58 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  52.82 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  53.43 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  53.18 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  52.25 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  50.94 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  52.73 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  51.78 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  51.54 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  51.31 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  52.96 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  52.01 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  51.29 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  53.32 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  52.01 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  51.77 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  53.32 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  50.95 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  52.35 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  52.72 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  51.42 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  51.06 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  52.01 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  50.95 
 
 		 403 aa  401  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  53.99 
 
 		 416 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  53.76 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  51.42 
 
 		 412 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  51.3 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  51.77 
 
 		 411 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  51.3 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  52.61 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  51.77 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  51.07 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  52.61 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  53.63 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  54.14 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  53.4 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  53.4 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  53.4 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  53.16 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  53.4 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  53.4 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  51.18 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  53.4 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  49.53 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  50.94 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  53.99 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  49.76 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  52.58 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  50.83 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  49.29 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  50.35 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  50.59 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  49.53 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0862  aspartate kinase  53.65 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  53.29 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  50.47 
 
 		 422 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  51.89 
 
 		 453 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  51.88 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  51.88 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>