More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1601 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1601  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
384 aa  780    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600148  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0654  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
403 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
358 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1174  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
402 aa  248  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0564  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
399 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00143817  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
402 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1911  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
399 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928726  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0894  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
399 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0139  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
404 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
402 aa  230  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
387 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 
387 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1193  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
310 aa  193  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2051  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
396 aa  185  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.73 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
397 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
393 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
395 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
368 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
386 aa  172  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
399 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
387 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
383 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  32.45 
 
 
390 aa  161  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 
383 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
387 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  30.53 
 
 
388 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
387 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
389 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  27.93 
 
 
381 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  29.01 
 
 
382 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
387 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
382 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1708  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 
254 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
387 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  27.78 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
387 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
383 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
389 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1381  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
386 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.05 
 
 
385 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
377 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
382 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
387 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.05 
 
 
385 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
383 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  27.86 
 
 
382 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
366 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.86 
 
 
382 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
387 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
387 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
382 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
387 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
382 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
382 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
371 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
382 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
386 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
382 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
382 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  29.89 
 
 
390 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
382 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
387 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
382 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  30.73 
 
 
390 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.67 
 
 
388 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 
383 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
383 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
382 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 
383 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
406 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.08 
 
 
384 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
387 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
383 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.13 
 
 
382 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
382 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
387 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0784  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
310 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000947408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
385 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  30.17 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>