More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1174 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1174  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
402 aa  816    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0139  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.44 
 
 
404 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0564  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.42 
 
 
399 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00143817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0654  iron-containing alcohol dehydrogenase  68 
 
 
403 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1911  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.42 
 
 
399 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928726  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0578  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.5 
 
 
402 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0894  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.66 
 
 
399 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  61 
 
 
402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.98 
 
 
358 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1193  iron-containing alcohol dehydrogenase  78.1 
 
 
310 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1708  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.23 
 
 
254 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2051  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.77 
 
 
402 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1601  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
384 aa  248  9e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600148  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  38 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
389 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.27 
 
 
382 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
383 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
389 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32 
 
 
382 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
382 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  30.87 
 
 
383 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.73 
 
 
392 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
382 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
383 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
397 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
382 aa  166  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
872 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.85 
 
 
382 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
403 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
388 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
387 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 
393 aa  160  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
387 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
389 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
382 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
395 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
388 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  30 
 
 
382 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
382 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.64 
 
 
388 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
382 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
387 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
387 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
383 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
379 aa  156  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
383 aa  156  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
387 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
383 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
384 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
387 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
382 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  30.18 
 
 
382 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
402 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 
383 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 
386 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  32.41 
 
 
382 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
382 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  30.18 
 
 
382 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  29.92 
 
 
382 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
387 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
402 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
387 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
383 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  31.28 
 
 
385 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
887 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  31.28 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
395 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
379 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.27 
 
 
380 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
387 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
386 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  32.31 
 
 
388 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  30.18 
 
 
381 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
383 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
383 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3674  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
887 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
399 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
382 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0145  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
384 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
382 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
382 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
382 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>