More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2051 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2051  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
402 aa  818    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 
402 aa  428  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0894  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 
399 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0654  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.77 
 
 
403 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0578  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
402 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1174  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.77 
 
 
402 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1911  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.87 
 
 
399 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928726  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0564  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
399 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00143817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0139  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 
404 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 
358 aa  364  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1193  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1708  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 
254 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600148  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  29.95 
 
 
383 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
382 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
388 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
382 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
388 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
358 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
383 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  30.32 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.42 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.42 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  30.32 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  30.03 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
387 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  31.49 
 
 
382 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  31.49 
 
 
382 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  31.2 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  31.49 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  31.2 
 
 
382 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  31.23 
 
 
381 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
393 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
387 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.85 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
382 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
382 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.66 
 
 
392 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
387 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
387 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  31.83 
 
 
382 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.85 
 
 
400 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
400 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
392 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.85 
 
 
400 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
383 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
382 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
382 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
382 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
403 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
389 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  32.47 
 
 
385 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  31.44 
 
 
382 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  30.29 
 
 
383 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  32.47 
 
 
385 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.42 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
382 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  28.99 
 
 
382 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
387 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.28 
 
 
384 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
393 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
398 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 
382 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.8 
 
 
393 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
383 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
382 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  32.01 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  30.73 
 
 
382 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
383 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
405 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
393 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  33.78 
 
 
490 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  33.78 
 
 
415 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  33.78 
 
 
415 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.83 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.74 
 
 
400 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>