More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0139 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0139  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 404 aa  815    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1174  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.44 
 
 		 402 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0578  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.42 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0564  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.92 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00143817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0654  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.49 
 
 		 403 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1193  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.74 
 
 		 310 aa  555  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1911  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.42 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.99 
 
 		 358 aa  532  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0894  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.66 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.66 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1708  iron-containing alcohol dehydrogenase  76.77 
 
 		 254 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2051  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1601  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.07 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.06 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.33 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.8 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.51 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.5 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 383 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  29.73 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  32.3 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.56 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 382 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 382 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 		 382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  30.57 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  30.37 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  30.37 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  33.33 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 		 406 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  32.68 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  31.45 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.26 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  34.93 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>