More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0279 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0279  argininosuccinate synthase  100 
 
 
322 aa  658    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00305758  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1834  argininosuccinate synthase  92.16 
 
 
387 aa  620  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.98788  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0969  argininosuccinate synthase  85.27 
 
 
319 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  hitchhiker  0.00000000000364513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0370  argininosuccinate synthase  84.28 
 
 
342 aa  545  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0765  argininosuccinate synthase  64.78 
 
 
382 aa  434  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.75777  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1700  argininosuccinate synthase  61.64 
 
 
406 aa  407  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.220206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1987  argininosuccinate synthase  58.49 
 
 
391 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.118414  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  56.63 
 
 
409 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  52.41 
 
 
406 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  52.41 
 
 
406 aa  331  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  52.41 
 
 
406 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  52.26 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  53.89 
 
 
397 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  50.49 
 
 
400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  49.07 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  53.72 
 
 
420 aa  312  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  51.29 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  51.29 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  51.29 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  51.94 
 
 
403 aa  310  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  50.81 
 
 
399 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0622  argininosuccinate synthase  51.74 
 
 
401 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 
400 aa  309  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  49.84 
 
 
400 aa  309  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 
399 aa  309  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  51.46 
 
 
400 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  51.46 
 
 
410 aa  306  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  49.51 
 
 
402 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  48.15 
 
 
402 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  49.19 
 
 
400 aa  305  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  50.32 
 
 
401 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  47.57 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  49.54 
 
 
403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  48.54 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  48.09 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 
401 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  48.56 
 
 
400 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  47.19 
 
 
401 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  49.03 
 
 
404 aa  299  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  50.81 
 
 
397 aa  299  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  48.08 
 
 
400 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  46.88 
 
 
401 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3610  argininosuccinate synthase  48.62 
 
 
431 aa  299  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00207012  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  47.19 
 
 
401 aa  298  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  47.83 
 
 
410 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  47.57 
 
 
401 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  47.57 
 
 
401 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  47.57 
 
 
396 aa  295  7e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  49.68 
 
 
399 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  45.68 
 
 
399 aa  295  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  48.4 
 
 
400 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  50 
 
 
400 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  46.28 
 
 
401 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  49.84 
 
 
400 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0116  argininosuccinate synthase  47.66 
 
 
395 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1072  argininosuccinate synthase  46.5 
 
 
397 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  46.73 
 
 
464 aa  290  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  48.22 
 
 
1496 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  48.71 
 
 
399 aa  289  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  48.38 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  48.7 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  48.7 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2373  argininosuccinate synthase  49.83 
 
 
395 aa  288  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.988806 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0875  argininosuccinate synthase  46.5 
 
 
397 aa  288  8e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  46.47 
 
 
404 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0873  argininosuccinate synthase  50.17 
 
 
394 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  46.08 
 
 
399 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  47.17 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  48.7 
 
 
401 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  46.25 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  45.83 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  45.83 
 
 
404 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1604  argininosuccinate synthase  47.13 
 
 
397 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  47.77 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  44.48 
 
 
409 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  46.45 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  46.15 
 
 
404 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  48.3 
 
 
405 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  46.75 
 
 
402 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  44.79 
 
 
409 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  44.89 
 
 
410 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0836  argininosuccinate synthase  49.14 
 
 
403 aa  277  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  46.93 
 
 
398 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  44.84 
 
 
406 aa  278  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0995  argininosuccinate synthase  47.65 
 
 
395 aa  277  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0324417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 
410 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  47 
 
 
414 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  46.75 
 
 
407 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  45.6 
 
 
396 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2320  argininosuccinate synthase  45.94 
 
 
395 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.301901  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  43.38 
 
 
413 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>