More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1987 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1987  argininosuccinate synthase  100 
 
 
391 aa  788    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.118414  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1700  argininosuccinate synthase  74.81 
 
 
406 aa  604  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.220206  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1834  argininosuccinate synthase  59.79 
 
 
387 aa  479  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.98788  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0765  argininosuccinate synthase  58.58 
 
 
382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.75777  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0370  argininosuccinate synthase  59.59 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0969  argininosuccinate synthase  61.01 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  hitchhiker  0.00000000000364513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0279  argininosuccinate synthase  58.49 
 
 
322 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00305758  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
406 aa  388  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
406 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
406 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
397 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  48.05 
 
 
413 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 
397 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  45.17 
 
 
420 aa  345  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  46.77 
 
 
401 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  43.15 
 
 
400 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  45.99 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  45.99 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0875  argininosuccinate synthase  47.03 
 
 
397 aa  339  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1072  argininosuccinate synthase  46.77 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  43.41 
 
 
400 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1604  argininosuccinate synthase  46.7 
 
 
397 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0622  argininosuccinate synthase  47.5 
 
 
401 aa  335  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  43.43 
 
 
402 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  44.65 
 
 
410 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  43.26 
 
 
399 aa  330  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  41.93 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  41.93 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  44.53 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  43.86 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  43.97 
 
 
406 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  43.18 
 
 
403 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  41.67 
 
 
400 aa  325  6e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2157  argininosuccinate synthase  43.9 
 
 
400 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000388575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  41.41 
 
 
400 aa  325  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  42.08 
 
 
401 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  41.15 
 
 
400 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  41.15 
 
 
399 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  44.13 
 
 
401 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  44.13 
 
 
401 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2052  argininosuccinate synthase  43.08 
 
 
399 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  43.6 
 
 
401 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  42.89 
 
 
399 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  43.67 
 
 
399 aa  322  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22270  argininosuccinate synthase  39.65 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.833135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  44.04 
 
 
400 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  44.68 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  42.12 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  44.27 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  43.86 
 
 
402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  42.6 
 
 
401 aa  319  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  42.6 
 
 
401 aa  319  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  41.67 
 
 
401 aa  319  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  43.23 
 
 
399 aa  319  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  42.04 
 
 
401 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  40.99 
 
 
412 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  42.23 
 
 
401 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  40.15 
 
 
412 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  43.96 
 
 
403 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  41.86 
 
 
402 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  43.23 
 
 
1496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0873  argininosuccinate synthase  45.01 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1117  argininosuccinate synthase  39.39 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  43.75 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  43.12 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  42.89 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  40.36 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  42.93 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2367  argininosuccinate synthase  39.79 
 
 
413 aa  312  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.518406  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  40.15 
 
 
412 aa  311  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  41.67 
 
 
401 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  42.89 
 
 
404 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3610  argininosuccinate synthase  42.17 
 
 
431 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00207012  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  42.38 
 
 
404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  42.97 
 
 
408 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  40 
 
 
404 aa  309  5e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  41.97 
 
 
400 aa  309  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  42.45 
 
 
397 aa  308  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  42.75 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  43.19 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  42.38 
 
 
404 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14340  argininosuccinate synthase  41.45 
 
 
413 aa  305  6e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00907828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2373  argininosuccinate synthase  44.27 
 
 
395 aa  305  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.988806 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  39.19 
 
 
399 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0116  argininosuccinate synthase  43.59 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3524  argininosuccinate synthase  40.15 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  42.19 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  42.15 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25570  argininosuccinate synthase  41.43 
 
 
402 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  40.15 
 
 
399 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>