More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2052 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  80.95 
 
 		 399 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2052  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 399 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  77.64 
 
 		 402 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2157  argininosuccinate synthase  80.4 
 
 		 400 aa  672    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000388575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  76.38 
 
 		 403 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  78.89 
 
 		 399 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  75.88 
 
 		 402 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  77.72 
 
 		 401 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  72.93 
 
 		 401 aa  617  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  72.61 
 
 		 401 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1117  argininosuccinate synthase  73.62 
 
 		 413 aa  616  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25570  argininosuccinate synthase  75.82 
 
 		 402 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22270  argininosuccinate synthase  72.61 
 
 		 414 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  73.37 
 
 		 412 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  70.89 
 
 		 412 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2367  argininosuccinate synthase  71.83 
 
 		 413 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.518406  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2966  argininosuccinate synthase  69.44 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3010  argininosuccinate synthase  69.44 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3308  argininosuccinate synthase  69.7 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3524  argininosuccinate synthase  68.94 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2981  argininosuccinate synthase  69.19 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0553526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  69.42 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  69.17 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14340  argininosuccinate synthase  70.85 
 
 		 413 aa  576  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00907828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11676  argininosuccinate synthase  68.59 
 
 		 398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.33354e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  67.67 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  64.23 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  62.22 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  55.15 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  55.96 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  53.42 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 		 401 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  52.19 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  52.15 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 399 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  48.59 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  51.5 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  50.9 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  51.92 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  50.26 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  49.1 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  49.13 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  51.41 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  49.48 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  51.41 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  50.39 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  49.36 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  47.84 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  48.85 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  49.25 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  48.33 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  47.3 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  47.09 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  46.87 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  47.63 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  46.41 
 
 		 1496 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  46.53 
 
 		 400 aa  362  9e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  45.92 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  46.79 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  48.07 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  45.76 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  45.71 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  46.37 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  45.69 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  47.47 
 
 		 399 aa  349  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  43.83 
 
 		 401 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  43.36 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3610  argininosuccinate synthase  44.33 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00207012  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  44.7 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  43.32 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>