56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3099 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 169 aa  344  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.46 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  41.46 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.2 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.43 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  35.12 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.53 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.13 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  39.29 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  34.53 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  34.53 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.35 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  38.81 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.97 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  39.56 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  42.47 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.47 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  37.66 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  37.35 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  34.94 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  26.09 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  37.18 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  45 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.96 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.18 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  32.53 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.14 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.44 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.02 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0260  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.91 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>