70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1751 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1751  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000562915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3141  hypothetical protein  95.76 
 
 
275 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1744  hypothetical protein  91.87 
 
 
277 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1766  hypothetical protein  89.05 
 
 
269 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1741  hypothetical protein  96.15 
 
 
52 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1758  hypothetical protein  92.31 
 
 
52 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367221  hitchhiker  0.00526717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1757  hypothetical protein  70.67 
 
 
63 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  28.35 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2072  hypothetical protein  25.17 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.166176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2074  hypothetical protein  24.83 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  25.35 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1544  hypothetical protein  32.43 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  25.18 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  23.66 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3233  hypothetical protein  27.06 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  27.67 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  24.61 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  64.44 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  24.61 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  24.91 
 
 
298 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  23.49 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  24.05 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  24.03 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0917  hypothetical protein  24.36 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  28 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  28 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  19.94 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  26.84 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  30.58 
 
 
317 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  22.27 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  21.23 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  21.23 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3444  hypothetical protein  52.73 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  26.36 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  22.13 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  22.13 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  22.13 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  24.37 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  23.74 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  23.74 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2677  hypothetical protein  25.36 
 
 
331 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  23.74 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  23.74 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  21.84 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  22.27 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3043  hypothetical protein  22.74 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0033024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  22.18 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2470  hypothetical protein  25.47 
 
 
315 aa  45.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.200487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  42.11 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1516  hypothetical protein  29.87 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.469218  normal  0.704146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0155  hypothetical protein  26.83 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  24.39 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  24.39 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  21.88 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  24.8 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  24.39 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  24.39 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  24.39 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  22.09 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  22.73 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1724  hypothetical protein  24.44 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  24.67 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  23.91 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  23.95 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3810  hypothetical protein  27.19 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00863066  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  24.39 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>