102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0895 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
99 aa  208  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  52.08 
 
 
101 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  45.05 
 
 
98 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.65 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  48.96 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  46.81 
 
 
99 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  47.25 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  48.91 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  43.96 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.67 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  48.35 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  46.32 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 
111 aa  84.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  49.4 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 
100 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  43.02 
 
 
95 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  45.26 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  42.71 
 
 
119 aa  81.6  3e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  43.43 
 
 
118 aa  81.6  3e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  45.98 
 
 
97 aa  81.3  4e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 
100 aa  80.5  6e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  44.44 
 
 
96 aa  80.5  7e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  44.44 
 
 
96 aa  80.5  7e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 
101 aa  80.1  9e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  41.3 
 
 
95 aa  80.1  9e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  40.66 
 
 
104 aa  79.3  1e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 
95 aa  79.7  1e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  43.96 
 
 
95 aa  79  2e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 
95 aa  79.3  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  39.36 
 
 
114 aa  77.8  4e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  47.13 
 
 
96 aa  77.8  4e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  46.59 
 
 
101 aa  77.8  4e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.44 
 
 
95 aa  78.2  4e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
98 aa  77  8e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 
95 aa  77  8e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 
95 aa  76.6  1e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  41.49 
 
 
113 aa  76.6  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 
95 aa  76.3  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  42.71 
 
 
95 aa  76.6  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 
125 aa  75.9  2e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  42.27 
 
 
121 aa  75.5  2e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 
130 aa  75.5  2e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.89 
 
 
95 aa  75.5  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 
110 aa  75.5  2e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 
102 aa  75.5  2e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  36.17 
 
 
110 aa  75.9  2e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.66 
 
 
100 aa  75.1  3e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  38.04 
 
 
120 aa  73.9  6e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  43.96 
 
 
95 aa  74.3  6e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 
95 aa  73.6  8e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.64 
 
 
96 aa  72  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  41.86 
 
 
107 aa  72.4  2e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.78 
 
 
96 aa  72.4  2e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.77 
 
 
96 aa  71.6  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 
107 aa  70.1  8e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 
99 aa  69.7  1e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 
95 aa  69.3  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  43.37 
 
 
100 aa  68.9  2e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  43.3 
 
 
98 aa  68.2  4e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  35.87 
 
 
95 aa  66.6  1e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  33.7 
 
 
113 aa  64.7  4e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  38.37 
 
 
100 aa  60.1  1e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  42.47 
 
 
79 aa  58.9  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  39.13 
 
 
80 aa  50.1  1e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  27.59 
 
 
116 aa  47.8  5e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  31.11 
 
 
104 aa  47  8e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  32.56 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  30.26 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  32.89 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  37.18 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  32.18 
 
 
93 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.82 
 
 
97 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  32.18 
 
 
93 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 
86 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  32.05 
 
 
106 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.28421e-08 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  27.37 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  30.49 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3490  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.44 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.62 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>