More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1827 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 428 aa  864    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  43.04 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  39.09 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  40.89 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  40.16 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  38.65 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  39.16 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  39.11 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  33.59 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  34.24 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  29.34 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  34.93 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  35.22 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  35.79 
 
 		 428 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  33.97 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  33.8 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  30.05 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.12 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  33.99 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  32.64 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  29.37 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  31.82 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  30.92 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.67 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  27.89 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  29 
 
 		 299 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  32.97 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  32.81 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.93 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  27.59 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  40.93 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  31.75 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  31.97 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  32.23 
 
 		 412 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.78 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  28.54 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.84 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.4 
 
 		 433 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.64 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.64 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.38 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  30 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.7 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.76 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  26.18 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.72 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  27.72 
 
 		 384 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3188  amidohydrolase  29.02 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  28.09 
 
 		 408 aa  103  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  27.23 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  28.28 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  24.18 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  24.18 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  24.18 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.31 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.02 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  24.18 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  25.46 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  23.94 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.81 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  28.35 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  24.18 
 
 		 435 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.18 
 
 		 435 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.14 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  28.17 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  28.42 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  26.52 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  29.85 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.9 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  25.31 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  25.93 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  27.02 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  27.02 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  23.71 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  23.71 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  24.94 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.74 
 
 		 445 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.81 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0252  amidohydrolase  28.35 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.99632  normal  0.114468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.78 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.43 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.51 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  22.36 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.56 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  26.75 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.86 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.19 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.43 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  30.68 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  26.46 
 
 		 466 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  36.15 
 
 		 503 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.47 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1212  chlorohydrolase  23.43 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.79 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.86 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.89 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.03 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  24.01 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  26.1 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>