38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4205 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  60.61 
 
 		 260 aa  314  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  43.48 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  38.68 
 
 		 480 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  38.14 
 
 		 515 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  36.32 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  34.75 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  33.48 
 
 		 611 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  35.35 
 
 		 636 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  29.58 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  29.58 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  29.68 
 
 		 655 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  28.22 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  25.43 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  28.33 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  26.92 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  30.19 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  25.81 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  26.46 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  24.5 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  28.49 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  25.48 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  26.39 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  23.44 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  25.13 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  26.85 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  26.39 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  25.58 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  24.38 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  24.38 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  24.53 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  24.81 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  22.36 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0618  hypothetical protein  44.26 
 
 		 355 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.409436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  25.79 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  22.84 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  24.04 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>