37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1331 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  67.05 
 
 
271 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  54.09 
 
 
274 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  42.91 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  38.25 
 
 
262 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  41.01 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  32.64 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  26.54 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  31.71 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  26.22 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  25.11 
 
 
611 aa  70.1  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  24.06 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  32.98 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  25.23 
 
 
480 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  32.98 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  26.89 
 
 
515 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  30.81 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  25.47 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  27.89 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  28.64 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  30.7 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  19.83 
 
 
381 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  24.77 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  24.05 
 
 
636 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  23 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  23 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  25.98 
 
 
485 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  21.92 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  25.82 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  23.44 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  25.53 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  26.9 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  25.81 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  22.17 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  24.34 
 
 
421 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1794  hypothetical protein  28.03 
 
 
354 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00770492  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  23.42 
 
 
655 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>