34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2060 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  44.71 
 
 
266 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  47.89 
 
 
262 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  40.32 
 
 
271 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  38.27 
 
 
274 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  37.12 
 
 
269 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  30.67 
 
 
271 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  28.89 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  25.26 
 
 
288 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  28.14 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  25.61 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  20.64 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  26.29 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  21.05 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  22.44 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  20.56 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  25.62 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  22.64 
 
 
515 aa  62  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  20.67 
 
 
381 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  29.89 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  29.89 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  28.86 
 
 
263 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  22.69 
 
 
480 aa  58.9  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  21.96 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  21.96 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  28.32 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  25.36 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  35.14 
 
 
485 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  23.48 
 
 
636 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  25.96 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  21.08 
 
 
438 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  20.8 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  25 
 
 
421 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>