35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50504 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  100 
 
 		 438 aa  902    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295961 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  45.61 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  56.76 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  36.21 
 
 		 611 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.360229 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  37.6 
 
 		 655 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  37.17 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  30.9 
 
 		 264 aa  160  4e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  35.63 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  37.74 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  30.97 
 
 		 268 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  30.97 
 
 		 268 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  31.96 
 
 		 268 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  25.63 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  25.83 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  29.5 
 
 		 254 aa  86.7  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  25.88 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  25.88 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  24.66 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  25.2 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  26.91 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  24.9 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  24.9 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  22.17 
 
 		 271 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  22.55 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  19.76 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  20.88 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  20.62 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  27.06 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  22.33 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  20.4 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  28.33 
 
 		 269 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  20.67 
 
 		 278 aa  43.5  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  20.63 
 
 		 258 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>