36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0703 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  67.05 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  54.15 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  43.2 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  40.8 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  42.66 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  38.14 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  27.7 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  27.04 
 
 		 515 aa  72  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  25.11 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  25 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  29.87 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  27.56 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  24.42 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  31.22 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  24.22 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  25 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  32.09 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  32.09 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  26.87 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  26.87 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  25.81 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  25.32 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  24.77 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  25.33 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  21.7 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  28.57 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  21.55 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  23.64 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  23.74 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  29.03 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  24.88 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  25.81 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  25.61 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  28.46 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1794  hypothetical protein  27.82 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00770492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>