33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1728 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  35.12 
 
 
266 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  31.91 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  25.97 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  31.01 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  31.71 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  27.43 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  27.68 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  26.51 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  27.27 
 
 
288 aa  72  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  24.64 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  29.87 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  33.56 
 
 
278 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  26.71 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  27.23 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  28.09 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  23.08 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  25.17 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  28.14 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  28.86 
 
 
278 aa  59.3  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  26.26 
 
 
480 aa  59.3  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  26.44 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  34.04 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  32.47 
 
 
515 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  28.49 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  24.66 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  25.71 
 
 
611 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4525  hypothetical protein  34.85 
 
 
387 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363926  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0021  hypothetical protein  35.48 
 
 
379 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314696 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  27.4 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  27.4 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  31.17 
 
 
485 aa  42  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>