35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0757 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  550  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  43.48 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  37.85 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  34.76 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  33.79 
 
 		 515 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  31.72 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  31.72 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  31.51 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  32.21 
 
 		 438 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  29.07 
 
 		 611 aa  95.9  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.360229 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  30 
 
 		 655 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  25.88 
 
 		 636 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  26.07 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  27.89 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  25.84 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  29.45 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  34.51 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  25.95 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  29.86 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  28.14 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  25.33 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  22.69 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  28.38 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  22.17 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  28.47 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  33.66 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  21.43 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  25.53 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  24.35 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  24.35 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  20.65 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  27.81 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  25.64 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  30.69 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0618  hypothetical protein  48.84 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.409436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>