28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58312 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  32.81 
 
 
421 aa  132  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  32.11 
 
 
636 aa  91.3  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  26.13 
 
 
480 aa  87.8  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  29.3 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  29.94 
 
 
611 aa  83.2  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  25.1 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  28.46 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  33.6 
 
 
485 aa  72.4  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  25.52 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  25.52 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  22.02 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  26.72 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  26.18 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  27.89 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  29.86 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  26.37 
 
 
655 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  26.28 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  26.28 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  28.32 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  34.04 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  26.06 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  28.3 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  26.28 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  23.13 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  23.35 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  26.28 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>