38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02721 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  60.61 
 
 
266 aa  315  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  37.85 
 
 
268 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  39.32 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  38.3 
 
 
515 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  38.57 
 
 
480 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  38.42 
 
 
438 aa  129  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  33.02 
 
 
611 aa  119  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  34.55 
 
 
636 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  31.31 
 
 
655 aa  111  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  30.13 
 
 
268 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  30.13 
 
 
268 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  26.72 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  30.81 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  28.3 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  27.12 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  26.32 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  31.51 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  27.91 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  27.19 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  27.78 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  29.63 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  25.64 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  25.64 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  26.77 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  27.01 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  23.12 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  24.32 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  25.17 
 
 
274 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  25.74 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  26.98 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  25.32 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0618  hypothetical protein  49.02 
 
 
355 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.409436  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  22.03 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  26.11 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  26.89 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  22.77 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  26.9 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>