More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4145 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 413 aa  839    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.09 
 
 		 420 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.06 
 
 		 415 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.61 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.61 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.85 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.61 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  70.7 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  70.7 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.4 
 
 		 415 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  70.46 
 
 		 415 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.46 
 
 		 415 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.4 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.58 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.25 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.54 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.01 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.01 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.03 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.33 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.33 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.93 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.61 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.88 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.47 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.57 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.61 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.65 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.59 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.09 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.03 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 		 415 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.72 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.95 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.43 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.67 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.57 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.07 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.17 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.01 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.7 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.1 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.33 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.66 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.82 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0212  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.39 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.51 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.78 
 
 		 426 aa  362  6e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0227  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.287759 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.71 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.39 
 
 		 431 aa  362  8e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.7 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.31 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.35 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.75 
 
 		 423 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.93 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.7 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 		 429 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.8 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.93 
 
 		 427 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.82 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.61 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.61 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.07 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.1 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.12 
 
 		 415 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>