More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4039 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  53.91 
 
 		 599 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  52.39 
 
 		 599 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  52.55 
 
 		 599 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  57.46 
 
 		 598 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  51.57 
 
 		 599 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  56.15 
 
 		 612 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  54.74 
 
 		 607 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  52.55 
 
 		 599 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  61.44 
 
 		 608 aa  762    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  53.41 
 
 		 599 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  52.05 
 
 		 601 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  52.39 
 
 		 599 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  52.55 
 
 		 599 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  53.91 
 
 		 599 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  52.55 
 
 		 599 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  53.74 
 
 		 599 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  52.92 
 
 		 623 aa  670    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  52.52 
 
 		 599 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  100 
 
 		 610 aa  1256    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  51.73 
 
 		 599 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  52.17 
 
 		 631 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  54.49 
 
 		 604 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  54.32 
 
 		 604 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  54.59 
 
 		 594 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  54.52 
 
 		 591 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  54.18 
 
 		 596 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  55.02 
 
 		 594 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  54.49 
 
 		 604 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  53.08 
 
 		 613 aa  670    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  53.01 
 
 		 614 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  55.07 
 
 		 600 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  52.06 
 
 		 599 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  52.22 
 
 		 599 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  52.4 
 
 		 599 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  53.58 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  51.31 
 
 		 599 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  54.35 
 
 		 602 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  51.06 
 
 		 599 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  50.98 
 
 		 599 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  52.14 
 
 		 599 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  50.5 
 
 		 607 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  51.16 
 
 		 609 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  50.91 
 
 		 609 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  52.11 
 
 		 612 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  52.88 
 
 		 600 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  52.72 
 
 		 600 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  50.33 
 
 		 605 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  47.93 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  47.21 
 
 		 595 aa  573  1.0000000000000001e-162  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  48.52 
 
 		 613 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  49.67 
 
 		 610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  48.36 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  47.99 
 
 		 969 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  47.77 
 
 		 608 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  46.41 
 
 		 615 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  42.83 
 
 		 614 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.54 
 
 		 600 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  46.91 
 
 		 883 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0752  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45.13 
 
 		 612 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0839  NADPH-sulfite reductase flavoprotein subunit  44.52 
 
 		 612 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.305761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  41.08 
 
 		 1397 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.32 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  43.32 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.01 
 
 		 1401 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  43.38 
 
 		 1403 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.54 
 
 		 626 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.54 
 
 		 629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  40.1 
 
 		 628 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  40.41 
 
 		 1405 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  40.73 
 
 		 1395 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  40.4 
 
 		 1397 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.9 
 
 		 1395 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  41.19 
 
 		 1400 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  40.56 
 
 		 1395 aa  439  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  40.56 
 
 		 1395 aa  439  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  40.2 
 
 		 1409 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.63 
 
 		 589 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.04 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  40.21 
 
 		 1398 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 		 593 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.59 
 
 		 595 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.46 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  41.13 
 
 		 1427 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  43.25 
 
 		 1257 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.13 
 
 		 1418 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  41.13 
 
 		 1418 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.13 
 
 		 1418 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.49 
 
 		 584 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.13 
 
 		 1418 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  41.13 
 
 		 1418 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.13 
 
 		 1418 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.51 
 
 		 582 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.31 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  42.7 
 
 		 1338 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  37.5 
 
 		 1407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  37.96 
 
 		 1384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  37.9 
 
 		 659 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  38.79 
 
 		 1341 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.93 
 
 		 1383 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  41.59 
 
 		 1357 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>